وفقا للتقليد المحلي، بينما كانت مريم العذراء والقديس يوسف في طريقهما إلى بيت لحم، جلسا عند هذا البئر طلبا لقسط من الراحة، وكانت السيدة العذراء عطشى، إذ بمياه البئر تصعد إلى أعلى وترويهما. يعتبر بئر السيدة الواقع في البلدة القديمة لمدينة بيت ساحور، من أعمق الآبار والأكثرها أهمية، حفره النبي يعقوب ابن اسحق في الصخر، ولغاية يومنا هذا لا أحد يعلم من أين تأتي مياهه. قام أهل بيت ساحور ببناء مزار فوق البئر ووضعوا أيقونات تقليدية ولوحات لتزيينه. يقال إن لدى البئر قوة قادرة على الشفاء تبجله جميع الطوائف الدينية من مسيحيين ومسلمين.